研 究 科 | 専 攻 | 講 座 (大学院講座) |
文学研究科 | 思想文化学 | 哲学，倫理学，文化価値論 |
| 歴史地域文化学 | 日本史学，東洋史学，西洋史学，歴史文化論，日本文化論，中国文化論，北方文化論 |
| 言語文学 | 西洋言語学，西洋文学，言語情報学 |
| 人間システム科学 | 心理システム科学，行動システム科学，社会システム科学，地域システム科学 |
４専攻 | １７講座 |
教育学研究科 | 教育学 | 教育臨床，教育計画，健康スポーツ科学 |
１専攻 | ３講座 |
法学研究科 | 法学政治学(4) | 民事法，公法，刑事法社会法，基礎法学，政治学 |
１専攻 | ５講座 |
経済学研究科 | 経済システム | 経済分析，社会経済・歴史分析 |
| 現代経済経営 | 現代政策，企業システム，国際分析 |
| 経営情報 | 経営情報分析，会計システム |
３専攻 | ７講座 |
理学研究科 | 数学 | 代数構造学，空間構造学，数理解析学 |
| 物理学 | 量子物理学，電子物性物理学，凝縮系物理学，非線形物理学 |
| 化学 | 分子構造化学，物性解析化学，機能分子化学，生命分子化学，分子変換化学 |
| 生物科学 | 系統進化学，形態機能学，行動知能学，生体情報分子学，生体高分子解析学，生体高分子設計学 |
| 地球惑星科学 | 地球惑星物質圏科学，地球惑星進化科学，地球惑星流体科学，地球惑星物理科学 |
５専攻 | ２２講座 |
医学研究科 | 生体機能学 | 分子生化学，生体機能構造学，統合生理学，情報薬理学 |
| 病態制御学 | 病態解析学，分子病態制御学，生殖・発達医学，感覚器病学 |
| 高次診断治療学 | 病態情報学，循環病態学，外科治療学，機能回復医学，侵襲制御医学 |
| 癌医学 | 癌制御医学 |
| 脳科学 | 神経機能学，神経病態学 |
| 社会医学 | 予防医学，社会医療管理学 |
６専攻 | １８講座 |
歯学研究科 | 口腔医学 | 口腔機能学，口腔健康科学，口腔病態学 |
１専攻 | ３講座 |
薬学研究科 | 生体分子薬学 | 細胞分子薬学，ゲノム機能学 |
| 創薬化学 | 創薬化学，機能分子設計学 |
| 医療薬学 | 医療薬学 |
３専攻 | ５講座 |
工学研究科 | 物質工学 | 材料物性工学，材料プロセス工学，機能材料化学 |
| 分子化学 | 精密合成化学，機能設計化学，界面制御工学，生物機能化学 |
| システム情報工学 | 数理情報工学，複雑系工学，制御情報工学，電磁エネルギーシステム工学，生体システム工学 |
| 電子情報工学 | 情報メディア工学，集積材料デバイス工学，物質情報エレクトロニクス，計算機情報通信工学，情報通信エレクトロニクス |
| 量子物理工学 | 極限物理工学，物質物理工学，波動量子物理工学，固体量子工学 |
| 量子エネルギー工学 | 原子力システム工学，プラズマ理工学，応用原子科学 |
| 機械科学 | 固体工学，設計機能工学，流体物理工学，熱エネルギー工学，宇宙環境工学 |
| 社会基盤工学 | 構造工学，空間構造学，環境構造材料工学，地盤工学 |
| 都市環境工学 | 都市環境計画学，交通システム工学，建築計画学，人間環境計画学，環境衛生工学 |
| 環境資源工学 | 環境保全システム工学，水圏工学，地殻資源工学，廃棄物資源工学 |
１０専攻 | ４２講座 |
農学研究科 | 生物資源生産学 | 作物生産生物学，園芸緑地学，家畜生産学，畜産資源開発学，生物生産工学，農業経済学 |
| 環境資源学 | 生物生態学体系学，地域環境学，森林資源科学，森林管理保全学，木材科学 |
| 応用生命科学 | 育種工学，応用分子生物学，生命有機化学，分子生命科学，食品科学 |
３専攻 | １６講座 |
獣医学研究科 | 獣医学 | 比較形態機能学，動物疾病制御学，診断治療学，環境獣医科学 |
１専攻 | ４講座 |
水産科学研究科 | 環境生物資源科学 | 多様性生物学，資源生産生態学，資源環境科学，資源計測学，生産システム学，生産工学 |
| 生命資源科学 | 生命機能学，育種生物学，応用生物科学，生物資源化学，水圏食糧科学 |
２専攻 | １１講座 |
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地球環境科学研究科
（独立研究科） | 地圏環境科学 | 地球生態学，地球環境変遷学 |
| 生態環境科学 | 地域生態系学，環境情報医学，資源化科学，生態遺伝学，環境分子生物学 |
| 物質環境科学 | 分子機能化学，物質機能化学，生体機能化学 |
| 大気海洋圏環境科学 | 大循環力学，化学物質循環，気象モデリング |
４専攻 | １３講座 |
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国際広報メディア研究科
（独立研究科） | 国際広報メディア | 公共伝達論，国際広報論 |
１専攻 | ２講座 |
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合 計
１４研究科 | ４５専攻 | １６８講座 |