北海道大学设有两个校区。主校区坐落在北海道首府札幌市市中心，交通极为便利。函馆校区坐落在北海道南部的海滨城市——函馆，这里以美丽的夜景闻名，水产系和水产研究生院设在函馆校区。
札幌校区
| 地址：北海道札幌市北区北8西5丁目 电话(总机)：+81-（0）11-716-2111 交通信息：利用JR时札幌站下车后步行5分钟。 利用地铁南北线时 北12条站下车后步行5分～15分钟。 北18条站下车后步行10分～15分钟。 地图：http://www.hokudai.ac.jp/bureau/map/guidemap.pdf |
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| 札幌校园 | |
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| 札幌校区位置图 | 从新千岁机场前往札幌校区的交通 |
函馆校区
| 地址：北海道函馆市港町3丁目1-1 电话(总机)：+81-（0）138-40-5505 邮箱：coe@fish.hokudai.ac.jp 交通信息： 由JR函馆车站搭乘函馆巴士101号线(北海道大学前下车•步行2分钟) 约需20分钟，出租汽车约需15分钟。 地图：http://www2.fish.hokudai.ac.jp/modules/article/content0082.html |
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| 函馆校园 |
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| 函馆校区位置图 |