＜植物園の発達＞
　植物園は、開園以降周囲の土地を入手しながら、分科園を整備してきました。同時に、植物園開園前の1876（明治9）年から始められていた外部の植物園との種子の交換を通じて植物の充実に力を注いできました。
　特に重視していたのは、樹木の種子の収集です。樹木の生育には時間がかかるため、優先して着手したと宮部博士の伝記には記されています。当時の植物園は、北海道の林業や園芸活動に精力的に協力しており、外国産植物が北海道に適応できるかどうかの試験場としての役割も果たしていました。このような活動を継続してきた結果、現在の植物園内では外国産の樹木を多く見ることができます。

　1900（明治33）年、植物園は公にその存在が認められました（官制化）。これにより、これまで「主任」と呼ばれていた職が「園長」として認められることになりました。

＜植物園の公開＞
　植物園は、開園当初出入りが自由になっていて、温室と博物館だけを日時を定めて公開するという形になっていましたが、管理上支障が生じたので、1909年に園の周囲に垣を設け、正門脇に門衛所を設置しました。1911年からは、ここで入園料（2銭）を徴収することになりました。

＜ロックガーデンの設置＞
　1938（昭和13）年に、植物園の南側に高山植物園（ロックガーデン）が設置されました。このロックガーデンは、面積約5,000�uの分科園で、北海道に自生するものを中心とした高山植物約600種類が植栽されています。設計・造成にあたっては、北海道の屋根と呼ばれる大雪山系のトムラウシ岳の八合目付近の風景を模したものと伝えられています。

　右の写真に見るように、土砂数百立方坪を積んで、小樽張碓産の古い火成岩大小3,000個を搬入して岩組を行う大規模な整備が行われました。また、景観だけを重視するのではなく、滝や渓流、砂礫地などを配置して、各種の高山植物の現生地における状態を植え込めるように設計されています。この他にも、スプリンクラーなど当時としては珍しい、植物管理の仕組みなども工夫され、当時は日本一の高山植物園といわれていました。

＜植物園の整備・発達＞
　太平洋戦争中、園内のローンを畑として利用していたこともありますが、戦後すぐに潅木園やバラ園、エンレイソウ園などを設け、研究フィールドとしての整備に着手していました。
　温室は、1932年に盧貞吉氏から新たな温室が寄贈され、幾度かの改修を経ながら現在に至っています。