北大植物園は北海道大学で最も早く、明治33年(1900年)に官制化された附属施設です。
札幌農学校が設けられた明治９年(1876年)、 札幌は今の道庁の東側にわずか８８４戸の家が点在する町でした。 道庁から西はハルニレ、イタヤカエデ、ヒロハノキハダ、ミズナラなどの大木が昼なお暗く茂っていました。 開拓使はこの辺りを牧羊場と定めましたが、明治１５年(1882年)そのなかに小さな博物場を建てました。 植物学者でもあったクラーク博士は、常に札幌農学校の教育研究に植物園の不可欠なることを熱心に説かれ、 開拓使にその設立を建議しました。 明治１７年(1884年)博物場とその附属地が植物園用地として札幌農学校に移管されました。 クラーク博士の後任ぺンハロー教師は早速種子を米国より取り寄せ、 数多くの樹種を植栽し札幌での適応性の研究を行いました。 そして、のちにハーバード大学へ留学する宮部金吾博士によって設計と築造がなされ、 明治１９年(1886年)植物園が創設されました。

それから１世紀、明治１９年(1886年)開園以来約１１０年の間、 植物園の歴史は決して単調なものではありません。札幌は都市化が進み周囲に高層ビルが建ち並び、 開園当時人口わずか14,900人の札幌も平成９年には約１８０万人の大都会となり、 町の西はずれにあった植物園も市街地のなかの緑の孤島となりました。 この間、園内の泉は涸れ、満々と水をたたえていた幽庭湖も大部分干上りました。 そのため地下水を汲み上げその水面を維持しています。創立当時の若いハルニレもすでに老木となり、 古いものは倒れ、若い木が次第に取ってかわりつつあります。樹林に見られる自然の遷移とともに、 環境の変化が植物園にさまざまな変貌をもたらしました。しかし、 園内にはまだ昔の面影を残す樹林も見られ、大都市のなかの貴重な存在となっていて、 春は萌黄色、夏は新緑、秋は紅葉、冬は雪景のハルニレ樹林に覆われます。 特に早春雪どけの林床は小さな妖精たちの色を競う生命力に驚かされます。
園内は広さ１３万３千�u、 １１０年前の自然地形に約4000種の植物を栽培・分類し生態学的展示を行なっています。 特に北方圏冷温帯植物・北海道固有植物の蒐集と保存(高山植物園、北方民族植物標本園など)、 外国産主要植物・エンレイソウの系統保存(樹木園・灌木園・草本分科園など)、 北方民族資料の蒐集保存(北方民族資料室・舟小屋)、 北方圏動物・哺乳類鳥類の剥製標本の蒐集と保存(博物館)及び重要文化財の建物などを一般市民に公開しています。 高山植物園など初夏が見頃です。

北大植物園は北海道のやや中央寄りにあり、日本海型気候区に属し、冬には雪が多く日照は少ないですが、 夏には比較的快晴日が多いです。風は冬には北西から、夏には南東から吹きます。 春先きの風がやや強いが、全年を通じては、あまりひどい風は吹きません。 日本海面の石狩から太平洋面の苫小牧に至る石狩低地帯の一角の、石狩川の支流豊平川扇状地に位置し、 昔の自然の地形と植物景観を現在に伝えます。従って植物園は札幌の自然史博物館でもあります。

北緯　 43°03´    年平均気温　               8.2℃     年平均降水量　1,129.6mm
東経　141°20´    日最高気温の月平均値(８月)26.1℃
海抜　18m          日最低気温の月平均値(１月)-8.4℃    (1961年から1990年の平均)