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　実験所では周辺の海から、海水をポンプでくみ上げています。そのため常に新鮮な海水で海産生物を飼育することができます。
　多くの生物は、温度や光周期の変化で自分の体をコントロールしています。そのため水温と光周期の管理は飼育実験をするうえで、非常に重要なポイントとなります。実験所には自由に温度や日長を設定できる飼育室が2つあり、様々な条件での飼育が可能です。

　主にＤＮＡの実験に使われている部屋です。近年、生態学の分野でもＤＮＡなどの遺伝子情報を駆使した研究が盛んに行われるようになりました。遺伝情報を利用することで、今までは推察するしかなかった「この親とあの親ではどちらが多く子供を残せるのか」という問題や「この集団とあの集団はどのくらい交流があるのか」という問題に対して、より正確に答えることができるようになりました。このような手法を用いることで、進化の過程をよりリアルに捉えることができるのです。
　実験所ではＤＮＡの抽出からプラスミドの精製、濃度測定、ＰＣＲ、シーケンス、電気泳動などの一連の実験ができる設備がそろっています。

主に組織切片の作成に使われている部屋です。包埋や染色等の組織切片を作るための道具が一通りそろっているので、生物の性分化や成熟度等細胞学や組織学的な観察をすることが出来ます。またここはアルコールやホルマリンなどの薬品の保管庫にもなっています。

　実験所では一番広い部屋です。年に何回か学部学生の臨海実習や、地域の小中学生を対象としたシュノーケリング教室などがこの場所で行われます。
　後ろには水道水と海水の両方使える広い流しがあり、普段は実験所の学生がサンプル処理などに利用しています。標本棚には周辺の海で採集された様々な海洋生物の標本が並んでいますが、ここにはなんと技官の野村さんが昔南極調査隊にいた頃採ってきた南極海の生物たちも混じっています。

周囲を天然の岩礁域に囲まれているという地の利を生かし、実験所ではフィールド研究が盛んに行われています。そのひとつがスクーバ潜水を用いた野外調査です。実際に海の中に入ってみると、室内実験だけでは見えてこなかった様々な不思議を生き物たちは見せてくれます。野外での観察と飼育実験を組み合わせることで、その不思議を紐解くことができるのです。この第２倉庫では、そのような潜水調査や飼育実験のためのさまざなま器材を収納しています。

サンプル瓶、マイクロチューブなどの消耗品や三枚網などのサンプリング用品、船用品などを収納しています。

　階段と踊り場の壁には様々な表情を見せる魚たちの写真が展示されています。そのほとんどが卵塊の保護行動、産卵行動、交尾行動などの生態写真で、いつか自分もこんな写真が撮りたい！という情熱が湧いてきます。
　残念なのが実験所のギャラリーなのに実験所周辺の海で撮られたものがほとんど無いこと・・・。このギャラリーに我々のフィールドの写真をもっと増やしたいなぁと思っている今日この頃。

　収容可能人数７２人。普段は実験所の院生がまるで我が家のように自由奔放に使っています。しかし年に数回、大学の授業の一環で臨海実習が行われ、このときは居室も満員になってしまうので院生は我が家を追い出されるわけです。いつも昭和の生活感がにじみ出ている宿泊棟にもこのときばかりは若さがみなぎります！
　和室と洋室の２種類あります。(写真は洋室）

某院生の推定によると最大２５人まで入れる巨大浴槽があります。水道管が凍結する冬季以外は週に１～２度お湯を張ってくれます。お風呂の日以外は地元の漁師さん絶賛の熱湯温泉に行って研究の疲れ（？）を癒します。

　夜の帳が降りる頃になると、ぽつりぽつりと学生たちが食堂に集まってきます。普段はそれぞれのペースで食事をとっていますが、何か心に衝撃が走った時にはみんなで一緒に晩御飯を作って食べることもあります。
　時々輪読会などのゼミをやったり、学会発表の練習をしたりするのにも使われます。
　写真はひな祭り！ということでちらし寿司なんぞを食べてみたりしているところ。

　臼尻町の外食事情は、ちょっと悲しくなるほど悪く、実験所を利用する学生たちはみな、基本的には自炊しています。実験所の厨房には、中華料理屋もびっくりの火力を誇るガスコンロ、前浜の幸をぞんぶんに活かしきる両面魚焼き機（ピザも作れる！！）など、自炊意欲を刺激する武器が数々そろっています。実験所の学生たちは日々ここで腕を磨いております。

小さな台所とテーブルがあります。学生、教官、職員の憩いの場であり、研究や実験所の将来について熱く議論を戦わせる場でもあります（？）。めいめい気ままにお茶を飲んだり新聞を読んだりしています。

国内、国外問わず様々な人たちが臼尻実験所を利用してほしいという思いを込めて作られた部屋です。現在は第２ＤＮＡ実験室としても使われています。

生物顕微鏡、実体顕微鏡が各１台ずつあります。
　
　(写真左)生物顕微鏡。蛍光顕微鏡、偏光顕微鏡、
　　　　　　微分干渉、顕微鏡の機能も備えています。
　
　(写真右）実体顕微鏡
　
　(写真中央)顕微鏡画像をデジタル化して保存したり
　　　　　　　　加工したりすることのできる装置です。

　潜水調査の際、岸からエントリーして調査ポイントに向かうことができます。東側と西側の２箇所あります。2008年5月には西側斜路が改修され新しくなりました。

　実験所所有の船外機付きの磯舟です。岸からやや離れた場所に潜水調査に行ったり、網や籠でのサンプリングをしたりする際に、技官の野村さんが舟を出してくれます。

　文字通りゲストのための家です。寒流の生物の野外調査や飼育実験、ＤＮＡ実験など、ここの施設を利用するために、他大学や他の研究機関、教育機関に所属する研究者の方もたびたび実験所を訪れます。そのような外部の研究者の方が気持ちよく過ごせるようにと、退職された技官の方のおうちを改装して作りました。シャンデリア付きの豪華さで（嘘）、先生も張り切って、なんと浴衣まで用意してしまいました（ほんと）。
　利用したいという方はこちらまで